- Short hairpin RNA
-
Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (shRNA — short hairpin RNA, small hairpin RNA) — молекулы коротких РНК, образующие во вторичной структуре плотные шпильки. ShRNA могут быть использованы для выключения экспрессии генов путем РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи вектора, использующего промотор U6, для обеспечения конститутивной экспрессии. Такой вектор, как правило, передается дочерним клеткам и обеспечивает наследуемое выключения гена.
Структура малых РНК, образующих шпильки, разрезается клеточными ферментами в малые интерферирующие РНК (siRNA), которые далее переходят в РНК-индуцируемый комплекс выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается и разрезает мРНК, участки которых комплементарны siRNA.
Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК полимеразой III. Образование shRNA в клетках млекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ, для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК полимеразой II.
Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. но в таком случае, не используют промотор U6. В растениях обычно используют традиционный промотор, обеспечивающий конститутивную экспрессию, — CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (cauliflower mosaic virus 35S promoter).
Типы нуклеиновых кислот Азотистые основания Пурины (Аденин, Гуанин) | Пиримидины (Урацил, Тимин, Цитозин) Нуклеозиды Аденозин | Гуанозин | Уридин | Тимидин | Цитидин Нуклеотиды монофосфаты (АМФ, ГМФ, UMP, ЦМФ) | дифосфаты (АДФ, ГДФ, УДФ, ЦДФ) | трифосфаты (АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ) | циклические (цАМФ, цГМФ, cADPR) Рибонуклеиновые кислоты РНК | мРНК | тРНК | рРНК | антисмысловые РНК | микроРНК | некодирующие РНК | piwi-interacting RNA | shRNA | малые интерферирующие РНК | малые ядерные РНК | малые ядрышковые РНК | тмРНК Дезоксирибонуклеиновые кислоты ДНК | кДНК | Геном | msDNA | Митохондриальная ДНК Аналоги нуклеиновых кислот GNA | LNA | ПНК | TNA | Морфолино Типы векторов en:phagemid | Плазмиды | Фаг лямбда | en:cosmid | en:P1 phage | en:fosmid | BAC | YAC | HAC
Wikimedia Foundation. 2010.