- Бактериородопсин
-
Тример бактериородопсина Обозначения в базах данных Pfam PF01036 InterPro IPR001425 PROSITE PDOC00291 SCOP 2brd TCDB 3.E.1 OPM family 6 OPM protein 1vgo Бактериородопсины — семейство мембранных светочувствительных белков археот (например, галобактерий). Бактериородопсины осуществляют перенос протона через плазматическую мембрану, по строению сходны с родопсинами млекопитающих.
Содержание
Состав белка
Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных -спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая -шпилька и все нерегулярные участки цепи (соединяющие спирали-петли) выходят из мембраны. Сидящие на -спиралях гидрофобные группы обращенны «наружу» к липидам (тоже гидрофобным) мембраны. Полярные же группы (их немного) обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.
Процесс переноса протона через мембрану
Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора — ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из полностью-транс в 13-цис форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.
Литература
- А. В. Финкельштейн, О. Б. Птицын, «Физика белка», 2002
См. также
Категория:- Белки
Wikimedia Foundation. 2010.